Linka S3 obsluhuje trať na Vánoční ostrov a spojuje střed světa s Vánočním ostrovem. Jde o historicky první zabezpečenou automatickou linku na Českém hvozdu.
Linka S3 byla uvedena do zkušebního provozu 1. ledna 2025. Během zkušebního provozu nastaly dva problémy:
Ke konci zkušebního provozu byla navíc v provozu kyvadlová linka hlavní nádraží — Třešňová, která měla testovat odolnost linky S3 proti náhodným kolizím a zpožděním.
Do ostrého provozu byla linka uvedena 14. ledna 2025.
V období od 14. do 17. ledna došlo na lince k dalšímu záseku. Vyšetřování zjistilo, že příčinou bylo, že vlak stojící v depu hlavního nádraží před návěstidlem měl nastavený příznak „vypnout ARS“, proto mu signalizace nenastavila vlakovou cestu. Původní příčina této skutečnosti je dosud neznámá.